dataminer.me

データマイニングやその周辺のお話を書くブログ

UbiGraph+Ubuntu+Python

大学の発表の(質をごまかす)ためにUbiGraphを入れた。

使おう使おうと思っていたので、ちょうどよいタイミングかもしれない。


材料:
・Ubigraph(Ubuntu用)

・Open GL用のパッケージ

sudo apt-get install libglut3

・Network解析用モジュールNetworkX

sudo apt-get install python-networkx

基本はこれだけでOK

Avi,Maayanの書いたScienceの論文から海馬CA1部位の

たんぱく質相互作用ネットワークをとってきて、描画して見たところ

・・・PCのスペックがしょぼくて、カクカクする。。。

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