Rでダイナミックベイジアンネットワーク

日本語で検索してあまり出てこなかったから、とりあえずメモ。

以前はWindowsでPython→Rっていう形でダイナミックベイジアンネットワークを

使っていたのだけど、開発環境をUbuntuに変えたので、再インストール。

（でも、割とGUIに頼った生活をしていたので、GUIのないRはきつい）

Rでダイナミックベイジアンネットワークを使うためのパッケージには

G1DBNというパッケージがあり、基本的にPythonとRの2択しか

選べない自分にとっては、Rでできることはとてもありがたい。

（PythonにもMocapyというダイナミックベイジアンが使えるモジュールがある）

一応、バイオインフォマティクスが専門であたりするので、

時系列の遺伝子発現データがテストファイルとして、登録されているのも

ありがたい。

使い方というか、実用例に関しては後日。

（G1DBNが使われている論文）
Identification of temporal association rules from time-series microarray data sets

H Nam, KY Lee, D Lee - BMC Bioinformatics, 2009

→R＋Pythonでダイナミックベイジアンネットワークを実行する
テストスクリプトはこちら。
http://d.hatena.ne.jp/yanashi/20100202/1265127424